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(1)子宫构造异常
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通会造成子宫腔积水，这是因为输卵管的积水因输卵管伞部(尾端)阻塞，造成输卵管内的积水往子宫腔流之故。持续性的子宫腔积水会造
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的品质不好或是量不足或
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是子宫腔内某种细胞素的量太少或者太多，都会影响胚胎的着床成功与否。像一种蛋白称为α V β 3，在胚胎着床(排卵后六天)前后，子宫内膜细胞会制造并释放。
如果在胚胎着床期，这种蛋白制造或者释放少，会引起胚胎着床失败。细胞素，像间白素1β(Interleukin(1L)-1β)太高或干扰素-Y太低也会引起胚胎着床失败。
(5)有自体免疫疾病或有偶血栓形成体质和习惯性流产有关是不争的事实，但和胚胎重复着床失败是否有关联，目前还没定论。像抗磷脂综合征是以后总自体免疫反应疾病，即紫红色的免疫细胞对身体细胞膜或者任何微小器官上的膜磷类化学物质产生抗体，然后经由抗原抗体反应破坏细胞组织。
抗磷脂综合征和习惯
性流产有关，但与胚胎着床失败的关系则有待确定。植入子宫的胚胎自
身有缺陷
(6)夫妻染色体有异常会影响胚胎的发育，使胚胎长到某一阶段即会停止生长。妻子患有染色体异常，像染色体平衡对调、嵌合型染色体、染色体反向转位、染色体缺失、染色体断裂(尤其是断裂在染色体中央节部位时，即使年轻女性做试管婴儿重复失败的几率也比较高)。
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